Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc83Q9D4V3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc83Q9D4V3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc83Q9D4V3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc83Q9D4V3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc83Q9D4V3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc83Q9D4V3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc83Q9D4V3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc83Q9D4V3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc83Q9D4V3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc83Q9D4V3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc83Q9D4V3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc83Q9D4V3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc83Q9D4V3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc83Q9D4V3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc83Q9D4V3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc83Q9D4V3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc83Q9D4V3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc83Q9D4V3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc83Q9D4V3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc83Q9D4V3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc83Q9D4V3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc83Q9D4V3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms