Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms