Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S6

Erich6b, Glutamate-rich 6B, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich6bQ9D4S6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Erich6bQ9D4S6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Erich6bQ9D4S6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Erich6bQ9D4S6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms