Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4931423N10RikQ9D4J9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms