Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efhd1Q9D4J1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms