Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933428M09RikQ9D3X3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms