Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2P4

Urm1, Ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urm1Q9D2P4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Urm1Q9D2P4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms