Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E3

4930583I09Rik, RIKEN cDNA 4930583I09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930583I09RikQ9D2E3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930583I09RikQ9D2E3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms