Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhdc8bQ9D2D9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhdc8bQ9D2D9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhdc8bQ9D2D9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhdc8bQ9D2D9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhdc8bQ9D2D9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhdc8bQ9D2D9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhdc8bQ9D2D9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhdc8bQ9D2D9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhdc8bQ9D2D9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhdc8bQ9D2D9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhdc8bQ9D2D9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhdc8bQ9D2D9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhdc8bQ9D2D9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhdc8bQ9D2D9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhdc8bQ9D2D9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhdc8bQ9D2D9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhdc8bQ9D2D9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms