Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1T0

Lingo1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo1Q9D1T0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lingo1Q9D1T0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lingo1Q9D1T0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lingo1Q9D1T0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lingo1Q9D1T0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lingo1Q9D1T0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lingo1Q9D1T0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lingo1Q9D1T0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lingo1Q9D1T0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lingo1Q9D1T0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lingo1Q9D1T0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms