Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Necap2Q9D1J1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Necap2Q9D1J1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms