Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1G1

Rab1b, Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1bQ9D1G1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab1bQ9D1G1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab1bQ9D1G1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab1bQ9D1G1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab1bQ9D1G1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab1bQ9D1G1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab1bQ9D1G1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab1bQ9D1G1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab1bQ9D1G1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab1bQ9D1G1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab1bQ9D1G1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab1bQ9D1G1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab1bQ9D1G1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab1bQ9D1G1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab1bQ9D1G1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab1bQ9D1G1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab1bQ9D1G1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab1bQ9D1G1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab1bQ9D1G1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab1bQ9D1G1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab1bQ9D1G1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab1bQ9D1G1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms