Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl28Q9D1B9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms