Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms