Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Arv1Q9D0U9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms