Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I8

Mrto4, mRNA turnover protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrto4Q9D0I8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrto4Q9D0I8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrto4Q9D0I8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms