Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shisa9Q9CZN4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shisa9Q9CZN4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shisa9Q9CZN4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shisa9Q9CZN4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa9Q9CZN4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa9Q9CZN4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa9Q9CZN4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa9Q9CZN4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa9Q9CZN4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa9Q9CZN4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa9Q9CZN4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa9Q9CZN4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa9Q9CZN4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa9Q9CZN4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa9Q9CZN4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa9Q9CZN4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa9Q9CZN4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa9Q9CZN4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa9Q9CZN4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa9Q9CZN4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa9Q9CZN4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shisa9Q9CZN4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shisa9Q9CZN4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shisa9Q9CZN4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shisa9Q9CZN4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Shisa9Q9CZN4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Shisa9Q9CZN4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Shisa9Q9CZN4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Shisa9Q9CZN4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Shisa9Q9CZN4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa9Q9CZN4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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