Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYQ5

Hcfc1r1, Host cell factor C1 regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcfc1r1Q9CYQ5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms