Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ssu72Q9CY97 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms