Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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