Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50aQ9CXL1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms