Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc3Q9CXE6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms