Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms