Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms