Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Sycp2Q9CUU3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Sycp2Q9CUU3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Sycp2Q9CUU3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms