Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms