Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRC3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRC3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CRC3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CRC3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CRC3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CRC3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CRC3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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