Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc43Q9CR29 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc43Q9CR29 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms