Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rer1Q9CQU3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms