Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdm1Q9CQK3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms