Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms