Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Use1Q9CQ56 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Use1Q9CQ56 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Use1Q9CQ56 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Use1Q9CQ56 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Use1Q9CQ56 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Use1Q9CQ56 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Use1Q9CQ56 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Use1Q9CQ56 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Use1Q9CQ56 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Use1Q9CQ56 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Use1Q9CQ56 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Use1Q9CQ56 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Use1Q9CQ56 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Use1Q9CQ56 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Use1Q9CQ56 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Use1Q9CQ56 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Use1Q9CQ56 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Use1Q9CQ56 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Use1Q9CQ56 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Use1Q9CQ56 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Use1Q9CQ56 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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