Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ11

2010109I03Rik, RIKEN cDNA 2010109I03, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010109I03RikQ9CQ11 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
2010109I03RikQ9CQ11 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
2010109I03RikQ9CQ11 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
2010109I03RikQ9CQ11 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
2010109I03RikQ9CQ11 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
2010109I03RikQ9CQ11 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
2010109I03RikQ9CQ11 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
2010109I03RikQ9CQ11 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
2010109I03RikQ9CQ11 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
2010109I03RikQ9CQ11 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
2010109I03RikQ9CQ11 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
2010109I03RikQ9CQ11 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
2010109I03RikQ9CQ11 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
2010109I03RikQ9CQ11 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
2010109I03RikQ9CQ11 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
2010109I03RikQ9CQ11 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms