Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KarsQ99MN1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KarsQ99MN1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms