Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnaja3Q99M87 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnaja3Q99M87 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms