Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms