Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms