Protein–RNA interactions for Protein: Q99L43

Cds2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds2Q99L43 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cds2Q99L43 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms