Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmp1Q99KU0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms