Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Rab28Q99KL7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms