Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn2aQ99KJ0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms