Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed9Q99KF1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
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