Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prss28Q924N9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prss28Q924N9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prss28Q924N9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prss28Q924N9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prss28Q924N9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prss28Q924N9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prss28Q924N9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms