Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Letmd1Q924L1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Letmd1Q924L1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Letmd1Q924L1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Letmd1Q924L1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Letmd1Q924L1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Letmd1Q924L1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Letmd1Q924L1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Letmd1Q924L1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Letmd1Q924L1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms