Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf3Q922U1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf3Q922U1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms