Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Clip1Q922J3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Clip1Q922J3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms