Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms