Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chrna2Q91X60 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chrna2Q91X60 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chrna2Q91X60 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna2Q91X60 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna2Q91X60 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna2Q91X60 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna2Q91X60 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna2Q91X60 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna2Q91X60 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna2Q91X60 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna2Q91X60 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna2Q91X60 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna2Q91X60 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna2Q91X60 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna2Q91X60 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna2Q91X60 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chrna2Q91X60 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chrna2Q91X60 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chrna2Q91X60 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chrna2Q91X60 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chrna2Q91X60 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna2Q91X60 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms