Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Odf4Q8VI88 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Odf4Q8VI88 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms