Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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